根敦嘉措在前藏各地活动，逐渐有了名望，他又在山南兴建了曲科杰寺。正德七年，意希孜莫请他返回扎什伦布寺，让他担任扎什伦布寺的法台，这可以说是格鲁派中活佛转世对师徒相传取得了优势。

这时，仁蚌巴下令禁止格鲁派僧人参加拉萨正月的祈愿大法会，哲蚌寺僧众请求根敦嘉措返回。正德十二年，根敦嘉措出任哲蚌寺法台，正德十三年，由他主持拉萨正月祈愿大法会，争回了格鲁派僧人参加祈愿大法会的权力。到了嘉靖四年，他又兼任色拉寺法台。

从此，根敦嘉措的历辈转世都要担任哲蚌寺和色拉寺的法台，这就使他的转世系统的影响和实际地位超过了甘丹赤巴，成为格鲁派的实际的领袖。内邬宗宗本还把哲蚌寺的别墅送给他，改名为甘丹颇章。

此后便是索南嘉措的时代了，这位活佛此前也有过介绍，就不多说了。要说的是，他在历史上就表现出极高的政治能力，被打压的格鲁派正是在他手中取得了其在蒙古的生机乃至大发展。

索南嘉措活佛在将黄教送往蒙古，并使其落地生根的过程中，有过三次最关键的举动，在原本的历史上，这三次举动都说明了他的政治眼光和手段。

第一次不必多说，就是和俺答的会晤与互赠尊号。

第二次则是他亲自赶往土默特主持俺答汗的葬礼——虽然在原历史上这件事拖得有点久，但那是因为其他因素导致的(活佛出行，一路为当地信众开坛，讲经说法)，活佛本人的决断没有任何迟疑。

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第三次则是他在圆寂之前就公开“预言”：四世活佛将在蒙古地区产生。这件事很有意思，因为他圆寂之后，黄教与土默特联合确认，他的转世灵童正是俺答的一位重孙，这位俺答汗的重孙也是历史上唯一一位蒙古族出身的活佛转世灵童。

原因不敢多说，反正高务实已经下了黑决心，以后转世灵童这档子事，咱们就提前开始搞鞑清历史上搞过的那一套——要不要照搬金瓶掣签制度无所谓，但反正就是把转世灵童的确认权收归大明来决定。

索南嘉措活佛如此有政治头脑的人，高务实说服起来反而更容易。

说服聪明人其实真的比说服蠢蛋容易得多，因为聪明人会审时度势，而蠢蛋只会钻进牛角尖里出不来。

这次高务实给索南嘉措的信中，除了对他弘扬佛法、劝人向善等功业歌功颂德了一番之外，真正最关键的事情就是三点：

一是告诉他这次来是帮俺答主持葬礼可以强化黄教在蒙古的地位；二是请他来为新任顺义王赠予尊号，可以获得新任的年轻顺义王接下来数十年的全力支持；三是这两件事做好之后，自己将会为他在大明皇帝面前讨得封号。

前两件事，索南嘉措活佛肯定是能看得出来的，而后一件事，以索南嘉措的水准，也肯定会相信高务实有这个能力。

在大明皇帝面前为他讨要一个封号重要么？

很重要，因为大明是“天下共主”，雪区那边不管内部怎么倾轧，现在都是尊奉大明为主的，一旦大明皇帝给他赐予了封号，黄教在雪区包括青海等地的根基就不可动摇了。