公元840年，回鹘由蒙古高原西迁而来，建立了以吐鲁番为中心的西州回鹘政权和以喀什噶尔为中心的喀喇汗王朝，

这两个王朝与当时的于阗王国共同组成了西域地区三个并立的政权。

由于回鹘汗国的西迁，不久，

公元866年，吐蕃最终退出了西域。

回鹘，原称回纥，是铁勒（中国古族名）诸部之一。

最初活动于色楞格河和鄂尔浑河流域，后迁居土拉河北。

公元744年，发展壮大了的回鹘于漠北建立政权，并两次出兵帮助唐朝中央政权平息“安史之乱”。

公元840年，回鹘汗国因自然灾害侵袭、统治集团内讧及黠戛斯（中国古老民族）的进攻等原因而崩溃，其部众大部分向西迁徙。

其中一支迁往今吉木萨尔和吐鲁番地区，后建立高昌回鹘王国；

还有一支迁往中亚草原，分布在中亚至喀什一带，与葛逻禄、样磨等民族一起建立了喀喇汗王朝，

自此，塔里木盆地周围地区受高昌回鹘王国和喀喇汗王朝统治，当地的居民和西迁后的回鹘互相融合，这就为后来维吾尔族的形成奠定了基础。

9世纪中叶后，吐蕃和回鹘都衰落下来，这一地区进入混战时期。

9世纪之后的中原王朝无暇顾及西域，西域出现了几个国家并列存在的局面。

其中主要有高昌、黑汗王朝和于阗等地方政权。

公元840年，漠北回鹘汗国覆灭高昌与喀喇汗王朝后，

由西迁西域的回鹘人汇同其他操突厥语诸族建立地方政权。

于阗是古老的塞人居地。

唐亡后，于阗尉迟王族执政，与中原地区往来密切，因曾受过唐朝册封而自称李姓。

九世纪末十世纪初，

伊斯兰教经中亚传入新疆南部地区。

十世纪中叶，信仰伊斯兰教的喀喇汗王朝发动了对于阗佛教王国历时四十余年的宗教战争，

于十一世纪初灭亡于阗，把伊斯兰教推行到和阗地区。

十四世纪中叶起，在察合台汗国（蒙古成吉思汗二子察合台在西域建立的藩属国）的强制推行下，

伊斯兰教逐渐成为察合台汗国的蒙古人、维吾尔人、哈萨克人、柯尔克孜人、塔吉克人等信仰的主要宗教。

十六世纪初，伊斯兰教最终取代佛教成为新疆的主要宗教，此为后话。

因为有西域在手，隋唐之时，中华再次站到了世界之巅，发出了对世界的又一次强大呐喊，

“四方胡虏，?凡有敢犯者，?必亡其国，?灭其种，?绝其苗裔。?

内外诸夷，?敢称兵者，?皆斩！?”?

隋唐荣耀，四方来朝，威震天下，霸气无双！！！